某有限责任公司为增值税一般纳税人，下设三个非独立核算的业务经营部门：零售商场、供电器材加工厂、工程安装施工队。前两个部门主要是生产和销售货物，工程安装施工队为公司所属的二级法人。根据现行营业税征税政策规定，安装业务收入应缴纳3％的营业税。
现假设公司2003年度取得建筑安装收入360万元，其中安装劳务费收入160万元，设备及材料价款200万元，购进该设备及材料价款支付的进项税额为22万元。施工队独立前，应按混合销售缴纳增值税：
销项税额=360÷(1+17％)×17％=52．31(万元)
假定可抵扣进项税额为22万元，则
应纳增值税=52．31-22=30．31(万元)
若施工队独立核算后，施工队只负责承接安装工程作业，只就安装劳务费收入160万元单独开票收款，并按营业税征税规定计税。此时，设备及材料价款200万元由原企业缴纳增值税，即：
应纳增值税=200÷(1+17％)×17%-22=7．06(万元)
而劳务费收入160万元，由新独立的施工公司缴纳营业税，即：
应纳营业税=160×3％=4．8(万元)
“两税”加在一起，则集团公司总纳税为：
7．06+4．8=11．86(万元)
比机构独立前，可节省税款金额为：
30．31-11．86=18．45(万元)
通过计算看出，企业在一定的情况下，分设机构或者设立新的机构，在一定程度上可以节省税款。实际经营中税款缴纳只是企业经营的一个部分，这里所讨论的只是税收问题。由于分设机构也可能会带来管理费用的增加，管理路径的拉长，影响效率，所以是否分设机构要总体考虑，权衡得失，使企业整体效益最高。
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